Caratterizzazione genetica del gene HA dei virus influenzali H9N2 a bassa patogenicità isolati in Israele nei periodi 2006-2012

I virus influenzali H9N2 sono stati isolati in Israele dal 2000 e sono diventati endemici. Dal novembre 2006 all'inizio del 2012, sono stati identificati molti virus H9N2, tutti appartenenti al lignaggio asiatico G1-like rappresentato da A/qu/Hong Kong/G1/97 (H9N2). Nel presente studio sono stati selezionati 66 isolati per la caratterizzazione del loro gene dell'emoagglutinina. La maggior parte degli isolati H9N2 era distribuita tra due gruppi principali, identificati come quarta e quinta introduzione. La quinta introduzione è rappresentata da un cluster compatto contenente virus isolati nel 2011-2012; la quarta introduzione è stata suddivisa in due sottogruppi, A e B, ciascuno contenente almeno due cluster, che possono essere identificati come A-1, A-2, B-1 e B2, rispettivamente. L'analisi genetica delle proteine HA dedotte dei virus appartenenti alla quarta e quinta introduzione ha rivelato variazioni aminoacidiche in 79 delle 542 posizioni. Tutti gli isolati presentavano i tipici motivi di bassa patogenicità nel sito di clivaggio dell'emoagglutinina (HA). La maggior parte dei virus presentava una leucina in posizione 216 in una tasca di legame al recettore che consente al virus di legarsi con successo ai recettori cellulari intrinseci dei mammiferi, compreso l'uomo. È stato dimostrato che le differenze tra le proteine HA dei virus utilizzati per la produzione del vaccino e gli isolati locali sul campo aumentavano parallelamente alla durata e all'intensità dell'uso del vaccino, illustrando la diversità genetica dei virus H9N2 in Israele.