Nonostante oltre 50 anni di vaccinazione della popolazione, l'incidenza della pertosse è in aumento. Sebbene la Bordetella pertussis sia considerata il principale agente causale della pertosse nell'uomo, le infezioni da Bordetella parapertussis non sono rare. I vaccini acellulari contro la pertosse (aP), ampiamente utilizzati, sono costituiti esclusivamente da antigeni di B. pertussis che hanno un'efficacia scarsa o nulla contro B. parapertussis. Qui ci chiediamo come la vaccinazione aP influisca sulle interazioni competitive tra le specie di Bordetella all'interno di ospiti roditori co-infetti e quindi sulla forza e la direzione della selezione all'interno dell'ospite guidata dall'aP. Abbiamo dimostrato che la vaccinazione contro l'aP ha contribuito a eliminare la B. pertussis, ma ha comportato un aumento di circa 40 volte delle unità formanti colonie (CFU) polmonari di B. parapertussis. Questa facilitazione vaccino-mediata di B. parapertussis non è il risultato di un rilascio competitivo; le CFU di B. parapertussis erano più alte negli ospiti vaccinati con aP rispetto a quelli vaccinati con sham, indipendentemente dal fatto che le infezioni fossero singole o miste. Inoltre, dimostriamo che la vaccinazione con aP ostacola l'immunità dell'ospite contro B. parapertussis, misurata come riduzione delle risposte infiammatorie polmonari e dei neutrofili. Pertanto, concludiamo che la vaccinazione con aP interferisce con la clearance ottimale di B. parapertussis e aumenta le prestazioni di questo patogeno. I nostri dati sollevano la possibilità che la vaccinazione aP diffusa possa creare ospiti più suscettibili all'infezione da B. parapertussis.