Rilevamento del virus simiano 40 nei tumori umani mediante reazione a catena della polimerasi

Il Simian virus (SV) 40 è un virus dell'acido desossiribonucleico (DNA) che induce mesoteliomi, ependimomi, tumori ossei e linfomi nei criceti. Negli ultimi anni sono state rilevate sequenze di SV40 in circa il 60% dei mesoteliomi e degli ependimomi, nel 33% dei tumori ossei e dei sarcomi e nel 13% dei linfomi. Poiché la quantità di campioni umani disponibili per gli studi molecolari è solitamente minima, il metodo più comunemente utilizzato per dimostrare la presenza di SV40 nei campioni umani è la reazione a catena della polimerasi (PCR). La PCR è una tecnica altamente sensibile e utile. Nella reazione di PCR, vengono utilizzate diverse serie di primer per colpire diverse regioni del DNA. Le regioni del genoma di SV40 che vengono prese di mira dalla PCR includono l'antigene T grande, l'antigene T piccolo, l'origine di replicazione e la proteina virale-1 del capside. L'uso di questi diversi set di primer per analizzare campioni di tumori umani per SV40 produce una diversa percentuale di risultati positivi. Questo perché gli esperimenti hanno rivelato che alcuni primer sono più specifici di altri e possono rilevare anche sequenze appartenenti ad altri papovavirus a DNA. Pertanto, si raccomanda l'uso combinato di diversi set di primer quando è importante distinguere l'SV40 da altri papovavirus correlati, come BK e JC, che possono essere occasionalmente presenti nelle cellule umane. Inoltre, questi esperimenti hanno dimostrato che le analisi di reazione a catena della polimerasi per il simian virus 40 possono essere eseguite meglio e più facilmente quando si utilizza l'acido desossiribonucleico estratto da tessuti freschi e/o congelati. L'acido desossiribonucleico ricavato da campioni inclusi in paraffina non dovrebbe essere utilizzato di routine per i test sul virus 40 della simia, a causa dell'elevato rischio di ottenere risultati falsi negativi. Tuttavia, questi acidi desossiribonucleici derivati da paraffina possono essere utilizzati in modo affidabile nei laboratori molecolari specializzati in questo tipo di analisi. Questo articolo descrive i metodi che abbiamo sviluppato per testare il virus 40 della simia in campioni umani.